La dirección y administración del RENATRE está a cargo de un Directorio integrado por cuatro directores provenientes de la asociación de trabajadores rurales con personería gremial y mayor representación a nivel nacional, la Unión Argentina de Trabajadores Rurales y Estibadores (UATRE), y por cuatro directores que representan a las entidades empresarias de la actividad: Confederación Intercooperativa Agropecuaria (CONINAGRO), Confederaciones Rurales Argentinas (CRA), Federación Agraria Argentina (FAA) y la Sociedad  Rural Argentina (SRA).